Das Nationale Referenzlaboratorium für Prozesskontaminanten in Lebens- und Futtermitteln der AGES ist primär in der Abteilung Kontaminantenanalytik des Instituts für Lebensmittelsicherheit Linz angesiedelt. 

Das National Food Institute an der Technical University of Denmark (DTU) betreibt das "EU Reference Laboratory for Processing Contaminants". Die nationalen Referenzlaboratorien der einzelnen Mitgliedstaaten unterstützen dieses gemeinschaftliche Referenzlaboratorium bei ihren Aufgaben und beweisen ihre hohe Kompetenz bei regelmäßig vom EU Referenzlabor veranstalteten Proficiency Tests und Workshops.

• Analysieren von Proben im Rahmen der Lebensmittel- u. Futtermittelkontrolle
• Durchführen von Vergleichsuntersuchungen u. Hilfestellung für Feldlabors (Routinelabors)
• Entwickeln und Validieren von neuen analytischen Methoden
• Unterstützung für das Bundesministerium für Soziales, Gesundheit, Pflege und Konsumentenschutz und das Bundesministerium für Land- und Forstwirtschaft, Regionen und Wasserwirtschaft bei fachlichen Fragestellungen
• Erteilen von Expertisen