Die Kontrollen der Lebensmittelaufsicht in Österreich auf nicht zugelassene GVO betreffen vor allem die Kennzeichnung von Soja und Mais. Weiters erfolgen im Anlassfall Importkontrollen und Marktkontrollen von Reis, Kartoffeln und Papayas. Für nicht zugelassenes genetisch verändertes Material gilt in der EU Nulltoleranz.

Geringe Spuren von genetisch verändertem Material können in Lebensmitteln und Futtermitteln zufällig vorhanden oder als Folge des Produktions- und Verarbeitungsprozesses technisch nicht vermeidbar sein. Das Vorhandensein von zugelassenem genetisch verändertem Material muss nicht gekennzeichnet werden, wenn der Anteil unter einem Schwellenwert von 0,9 % liegt und wenn nachgewiesen werden kann, dass sein Vorhandensein unbeabsichtigt und technisch unvermeidbar ist.
 

Jahr	Proben-anzahl	Soja	Mais	Soja und Mais	negativ	positiv	über dem Schwellen-wert	beanstandet bezüglich GVO
2001	153	59	54	40	144	9	4	2,60%
2002	251	162	61	28	222	29	1	0,40%
2003	250	141	102	7	192	49	1	0,40%
2004	241	145	87	9	233	8	2	0,80%
2005	242	140	96	6	237	5	0	0,00%
2006	249	148	101	0	249	0	0	0,00%
2007	212	112	100	0	146	66	0	0,00%
2008	199	111	88	0	123	76	0	0,00%

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